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【本文為疾病百科知識,僅供閱讀】 2020-04-20 作者:厚樸方舟
近日,UCSF 的 Clifford Lowell 教授在免疫學會議上做了一場關于全球新冠研究進展的總結性報告,涵蓋了學術界對新冠起源、發(fā)病、病理過程、傳染途徑、傳染性以及治療和疫苗研究等各方面的新權威進展。本文回顧分析了報告中提到的主要研究文獻,這些數據和文獻大多來源于WHO、Nature、Science、Lancet和NEJM,希望通過簡略總結,讓我們能夠更好的了解和防范新冠病毒,減少恐慌。
病毒來源和致病性
目前大自然中已知的病毒有α、β和γ三種分型,主要感染鳥類和哺乳動物。已知感染人類的冠狀病毒均為β-病毒,病毒引起的普通流感的致病率約為15%。近年來出現的新的致病病毒包括SARS-CoV(嚴重急性呼吸窘迫綜合征病毒,2002),MERS(中東呼吸綜合癥病毒,2012)和現在的SARS-CoV-2(嚴重急性呼吸窘迫綜合征病毒-2型,2019)。由SARS-CoV-2感染導致的疾病,被WHO命名為COVID-19,基因組30kb,是具有完整包膜和冠狀鏈的ssRNA病毒,是目前已知較大的RNA病毒。
基因組學研究提示[1],SARS-CoV-2病毒主要分為3個功能區(qū):ORF1a/1b非結構多蛋白,由16個小蛋白組成,參與病毒復制;結構蛋白,包括刺突蛋白、包膜蛋白、膜蛋白和核衣殼,其中刺突蛋白的細胞受體是ACE2(血管緊張素轉換酶抑制劑2),參與人體細胞錨定;ORF3-9在SARS-CoV和SARS-CoV-2之間存在差異,可能參與編碼修飾細胞先天性免疫應答的蛋白(圖1)。研究發(fā)現[2-4],SARS-CoV-2與2002年的SARS-CoV在ORF1a的差異與SARS-CoV-2的快速復制有關(圖2、3)。刺突蛋白是重組體,蝙蝠攜帶的冠狀病毒并不會錨定人類ACE2,SARS-CoV-2的刺突蛋白來源于蝙蝠和穿山甲的重組,對人類的ACE2具有高度親和力[5](圖4);同時含有Furin蛋白酶切位點[6](圖5),可以促進病毒更好的侵入細胞,從細胞獲取營養(yǎng)。這些突變,使得病毒從蝙蝠跨種群傳染給人類。這些結構的變異提示,病毒在動物之間的傳染過程中不斷被重組,在重組過程中,SARS-CoV-2獲得了快速復制能力、對人類的致病性(較低)、更高的傳染性以及更好的穩(wěn)定性[7],比如,在塑料和鋼鐵表面可存活0.5~6小時,在紙質表面存活時間較短,可以經腸道排泄等。
通過基因測序追蹤病毒的進化,有助于進一步研究病毒在人類的傳播和進化,目前已經發(fā)現了5個主要的進化株[8](圖6)。
▲圖1
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▲圖2
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▲圖3
▲圖4
▲圖5
▲圖6
檢測
目前常用的RT-PCR技能,通過檢測病毒的RdRp、N和E三個位點,用于輔助臨床診斷。PRA技能,通過檢測3種蛋白質和鏈置換聚合酶,探針添加了RT和內切/外切核酸酶,可以快速檢測。CRISPR-Cas12/13核酸檢測技能,直接與病毒RNA或DNA結合,與PRA技能聯合,可以提高檢測的敏感性[9]。血清抗體檢測,在SARS和MERS流行時的臨床經驗下發(fā)展起來,檢測血清中的抗原蛋白,但是不同的抗原檢測方法有效性都有待于進一步研究證實[10]。
傳染性和無癥狀感染者
SARS-CoV-2的平均倍增時間(感染人數加倍的平均時間)是6.2天,平均潛伏期是12天(圖7);分析死亡患者的發(fā)病過程,發(fā)現從確診到死亡的平均時間是17.3天[11]。與其他病毒不同,SARS-CoV-2病毒的傳染力在患者感染初期已經達到高峰,“出道即頂峰”是其主要特點,在患者出現癥狀被確診前,患者已經具備傳染力(圖8)。雖然,目前病毒的確切傳染力尚未明確,但是根據WHO的統(tǒng)計,其R0(每個患者感染的平均人數)為1.5-3.5。
▲圖7
▲圖8
關于無癥狀傳播者的報道越來越多,德國關于無癥狀傳播者的研究顯示,無癥狀傳播者約為15%(圖9)[12]。中國關于兒童的隊列研究也發(fā)現,15.8%為無癥狀感染[13]。
▲圖9
病理過程
SARS-CoV-2病毒感染人體的病理過程主要是導致免疫系統(tǒng)失衡,病毒特異性結合人體肺泡細胞的ACE,產生大量炎癥細胞,包括單核細胞和中性粒細胞(圖10)[14],導致肺泡上皮細胞脫落,屏障作用消失,肺泡水腫,氧氣交換功能障礙,導致肺炎或急性肺損傷(ARDS),其他靶器官(主要是肝臟、心肌)也會發(fā)生類似的病理性損傷,體內細胞因子風暴(TNFα,IL-1,Il-6,CXCL8,CCL2)啟動(圖11)[15-17] 。
▲圖10
▲圖11
重癥和治療
感染新冠病毒的患者中,96%為輕癥,4%為重癥,死亡率為0.7-3.4%。值得注意的是,在已經結束治療的案例中,79%為輕癥,21%為重癥[11,18]。這可能是隨著時間的推移,醫(yī)生對于COVID-19的診療具有更加豐富的經驗,因此,重癥的比例逐漸下降,也可能是病毒的變異導致致病力逐漸減弱。當然這些都有待于科學家們進一步研究證實。
起初有很多研究聲稱,兒童對于SARS-CoV-2非易感。但是隨著研究的深入[13],科學家們發(fā)現,兒童的感染率為12.3%,中位年齡6.7歲,15.8%為無癥狀感染;1%會進展為肺炎或者重癥;其他患兒為發(fā)熱、咳嗽、咽部紅腫等中度,所有重癥患兒均有基礎疾病(腎積水、白血病、腸套疊)。數據追蹤發(fā)現[11],老年人更容易感染SARS-CoV-2,且感染后更容易發(fā)展為重癥(圖12)。這可能與老年人接觸的病原更多,存在慢性疾病、腫瘤等基礎疾病,免疫反應較弱,B-細胞較少,更多等細胞毒性T細胞積累有關[19](圖13)。但是現有的研究尚不足以證明,SARS-CoV-2的感染和發(fā)病存在年齡差異。
▲圖12
▲圖13
以上數據表明,SARS-CoV-2感染早期可能是抗病毒治療的理想時機,通過快速降低患者體內的病毒負荷,可以阻斷患者進展為ARDS,降低死亡率。疾病進入后期,極強的細胞因子已經被觸發(fā),患者進展為ARDS。
抗體的保護性和疫苗研究
在以往針對SARS和MERS的研究發(fā)現,感染者體內的IgA水平與疾病進展呈負相關??筂ERS IgA衰落很快[20],但是抗SRAS IgG在感染后1年時達到峰值,可在人體持續(xù)存在長達12年[21]。SARS的亞基和滅活病毒疫苗,在老鼠和獼猴的動物模型效果很好,但是在其他的動物實驗中并未發(fā)現相同結果,這可能與抗體依賴性增強有關[20]。因為存在抗體依賴性增強,以往感染過其他冠狀病毒的患者可能會對SARS-CoV-2產生過度免疫反應,從而激活ACE。因此,關于SARS-CoV-2的疫苗以及血漿治療方法,還需要更多的研究證實,目前下結論為時過早[14]。
除了參考來源,給大家介紹兩個統(tǒng)計網站,可以查詢每天實時數據。
▲圖源:https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6
▲圖源:https://www.statnews.com/2020/03/26/covid-19-tracker/
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